Некоторым больным санаторно-курортное лечение категорически противопоказано. До санаторного лечения не допускаются пациенты при наличии заболеваний в острой стадии, острых инфекционных заболеваний, а также при наличии гнойных осложнений. Не выдают направление и при выявлении у пациента венерических болезней в острой или заразной стадии, психических заболеваний, наркомании, хронического алкоголизма. Не рекомендовано проходить курортную реабилитацию при наличии кахексии любой этиологии, злокачественных опухолей, часто рецидивирующих и обильных кровотечений. Противопоказано санаторное лечение при беременности после 26 недель и беременности во все сроки при наличии акушерской патологии, а также при туберкулезе в активной стадии.

В зависимости от заболевания врач выдает направление на специализированный курорт. Определив показания к курортному лечению и установив вид курорта, врач выписывает пациенту предварительную медицинскую справку, которая является основанием для получения путевки на санаторно-курортное лечение. Срок действия справки составляет 2 месяца. После того как пациент покупает путевку, врач заменяет справку на санаторно-курортную карту, которая является действительной в течение 2 месяцев. По приезде в санаторий больной обязан предъявить путевку и санаторно-курортную карту. Эта документация очень важна, не стоит пренебрегать такими формальностями, поскольку без санаторно-курортной карты больного на лечение в санаторий не примут. Кроме того, санаторий не берет на лечение тех пациентов, которые направлены не по основному профилю, причем материальные издержки компенсируются за счет направившей организации. В санатории после прохождения медицинского осмотра больному выдается курортная книжка, куда записывают основной диагноз, отмечают лечебные и диагностические процедуры. После выполнения каждой процедуры делаются соответствующие отметки в курортной книжке. После пройденного курса санаторной реабилитации в курортную книжку больного записываются результаты лечения и рекомендации по дальнейшему лечению. Санаторно-курортная реабилитация обычно проводится в период отпуска. В случае, когда отпуска недостаточно для лечения и проезда на курорт, пациенту выдают больничный лист на необходимое количество дней, если потребность в санаторно-курортном лечении была установлена лечащим врачом, а также заведующим отделением или главным врачом. Оформление и выдача больничного листа проводятся врачебно-консультационной комиссией. Если в поликлинике нет такой комиссии, то больничный лист выдается лечащим и главным врачом. Для оформления больничного листа необходимо иметь при себе следующие документы: путевку, документ, подтверждающий предоставление путевки данному пациенту за счет социального страхования или с доплатой 30 % от стоимости, карту санаторно-курортного отбора. Больничный лист может быть продлен в санатории в случае, если к моменту выписки пациент нетрудоспособен из-за возникшего острого заболевания или вследствие обострения основного заболевания.